Confidentialité des données personnelles
En 2018, My Heritage et plusieurs autres sites d'entreprises américaines comme MyFitness Pal sont victimes d'un piratage informatique. MyHeritage annonce elle-même avoir fait partie des victimes de ce piratage[53]. Les données de 92 millions de comptes MyrHeritage (identifiants et mots de passe) sont volées, avant d'être mises en vente sur un site pirate en février 2019 pour l'équivalent en 20 000 euros[54]. Le magazine en ligne The Register, spécialisé dans les technologies de l'Internet, indique que les mots de passe de MyHeritage étaient chiffrés avec un protocole obsolète facile à casser[55].
Début 2021, My Heritage met à disposition l'application DeepNostalgia, qui permet d'animer gratuitement une photographie à la condition de se créer un compte sur MyHeritage. Le journal Le Monde invite à la prudence envers cette application, craignant qu'elle n'aboutisse à fournir à l'entreprise des données personnelles qu'elle est susceptible d'intégrer à ses bases de données, y compris en les recoupant avec ses données génétiques[56].
Infractions à la loi française en matière de tests génétiques
En dépit de l'interdiction des tests génétiques en France, MyHeritage, comme plusieurs autres entreprises étrangères, produit et rentabilise une importante quantité de données génétiques françaises en commercialisant sur Internet des tests que l'on peut acheter depuis la France, puis en traitant les données fournies par ces tests. Cette attitude ambivalente envers la loi française est dénoncée par plusieurs généticiens et bioéthiciens français dans une tribune parue dans le journal Le Monde en janvier 2019[57].
MyHeritage est mis en cause dans des tentatives d’arnaque à la carte bancaire. En effet, la société propose un abonnement gratuit de 30 jours lorsque vous achetez un test ADN. Elle prélève alors 30 jours plus tard sans autorisation 134€. Plusieurs plaintes sont en cours en France.